Ausstattung am Institut für Biochemie und Signaltransduktion
Auf dieser Seite möchten wir Sie über die technische Ausstattung unseres Instituts informieren.
Wir sind bestrebt, unser Fachwissen und unsere Ausstattung zu teilen. Bitte richten Sie Ihre Anfragen an das Sekretariat des Instituts (Kerstin Schluenz, k.hambrock@uke.de ).
Inhalt
| Analytische Instrumente | Protein- und Probenherstellung | Kultivierung und Prozessierung von Zellen |
|---|---|---|
| Analytische HPLC | FPLC Systeme | Zellkultur |
| Massenspektrometrie | Pipettierroboter | Elektroporation |
| Lichtspektroskopie | Probenvorbereitung für die Massenspektrometrie | Schüttelinkubation |
| Multi-modaler Platten Leser | Gefriertrocknung und Vakuumkonzentrierung | Fermentation |
| Bildgebende Systeme | Zellaufschluss | |
| Quantitative Echtzeit-PCR | Superspeed- und Ultrazentrifugation |
Analytische Instrumente
Analytische HPCL
Prominence UFPLC
Shimadzu
Komponenten / Spezifikationen:
Automatisierter Probengeber
Binäre Gradientenpumpe (bis zu 400 bar)
UV-Vis und Fluoreszenzdetektor
Fraktioniereinheit
Anwendungen:
Protein Bindestudien mittels analytischer Größenausschlusschromatographie (aSEC)
Nukleotid Analysen und Quantifizierungen (Ionenpaarung bei Umkehrphasenchromatographie)
Umkehrphasenchromatographie von entfalteten Proteinen and Peptiden
Massensprektrometrie
amaZon speed LCMS
Bruker Daltonik
Spezifikationen:
Bauart: 3D-Ionenfalle (Paul-Trap)
Detektionsbereich: m/z 50-3000 and m/z 200-6000
Scan-Auflösung: 52.000 u/sek bei 0,58 u FWHM
Electro-Spray Ionisierung (Apollo II ESI-Quelle)
MS/MS-Modus: Fragmentierung mittels CID
gekoppelte Flüssigchromatographie: Ultimate 3000 UHPLC (Thermo)
Ausgewählte Anwendungen:
Massenbestimmung kleiner Proteine (bis ca. 50 kDa)
Bottom-Up Proteomik mittels MS/MS-Analysen von Peptiden
Strukturaufklärung und Quantifizierung von Metaboliten und organischen Verbindungen
maXis II ETD LCMS
Bruker Daltonik
Spezifikationen:
Bauart: Ultra-hochauflösender Q-TOF Analysator
Quadrupol Selektion: bis zu 3000 m/z
Detektionsbereich: 50-40000 m/z
Auflösung bei voller Sensitivität: 80,000 FSR (full sensitivity resolution)
Electro-Spray Ionisation (ESI + NanoESI Quelle inkl. NanoBooster Dopant-Eintrag)
MS/MS-Modus: Fragmentierung mittels CID+ETD (parallel im selben Lauf)
gekoppelte Flüssigchromatographie: Elute UHPLC (Bruker)
Ausgewählte Anwendungen:
Präzise Massenbestimmung großer intakter Proteine (bis zu 200 kDa)
Proteinsequenzierung intakter Proteine mittels Top-Down Proteomik
Massenbestimmung nativ gefalteter Proteine
Quantifizierung oder Strukturbestimmung organischer Moleküle und Metaboliten (in DDA oder DIA Modus)
Lichtspektroskopie
Fluoreszenz Spektrometer FP-8300
JASCO
Spezifikationen:
Küvetten-basiertes Instrument
Monochromatoren: 200 - 900 nm (Ex. und Em.)
Sensitivität: >8000:1 (QMW)
Zubehör:
- Polarisationsfilter für UV-Vis
- Temperierter Küvettenhalter (ein Steckplatz)
- Magnetrührer – frei einstellbar
- Diverse Quartzküvetten
Ausgewählte Anwendungen:
Fluoreszenzintensität-basierte Enzym- and Substratkinetiken (FI)
Anisotropie-basierte Bindestudien mittels Fluoreszenzpolarisation (FP)
UV-Vis Spektrometer Lambda20
PerkinElmer
Spezifikationen:
Küvetten-basiertes Zweistrahl-Instrument
Monochromatoren: 200 - 800 nm
Zubehör:
- Diverse Küvettenhalter (1-8 Steckplätze)
- temperierbar (extern)
- Diverse Quartzküvetten
Anwendungen:
Zeitaufgelöste Enzym- and Substratkinetiken
Enzym-gekoppelte Nachweisverfahren
Scannen von Absorptionsspektren
Multimodaler Plattenleser
Spark
Tecan
Spezifikationen:
Auslesen von 1well bis 1536well ANSI/SBS Platten
Temperierbar: 18-45°C (langzeitstabil)
Duale Optik: Filter sowie Monochromatoren
Messverfahren:
- Absorption UV-Vis: 200 – 1000 nm (Ex. und Em.)
- Fluoreszenz (FP + FI von oben und unten; TRF; FRET)
- Lumineszenz – glow, flash, mehrfarben und Spektren
Zubehör:
- Injektoren - zwei Kanäle min. 5 µL
- Automatischer Deckelheber
- IR-Laser für ALPHA-Technologie
- Mikroskop: Hellfeld-Optik
- NanoQuant-Platte / Feuchtkammer / Cell-Chip-Adapter
- Küvettenhalter für Absorbtionsmessungen
Ausgewählte Anwendungen:
Enzymkinetische Studien über optische Messverfahren (z.B. Fluoreszenz-Intensität; FI)
Anisotropie-basierte Bindungsstudien über Fluoreszenz-Polarisation (FP)
24well-Kultur-Screening-Plattform (E. coli und Hefe)
DNA/RNA- sowie Proteinquantifizierung im Hochdurchsatz und in geringen Volumina (2 µL)
Bildgebende Systeme
BZ 9000 Fluoreszenz Mikroskop
Keyence
Spezifikationen:
Auflösung: 1360 x 1024 Pixel
Hellfeld (DIC)
Fluoreszenz Anregungsfilter:
rot (Cy5; 568 nm); grün (GFP; 488 nm); blau (DAPI; 358 nm)
CO2-kontrollierte und temperierbare Kammer
Anwendungen:
Bildgebung von Objektträgern und Zellkulturschalen (keine Mikrotiterplatten)
Scannen kleiner Kultivierungskammern
Mehrpunkt-Bildgebung Fluoreszenz-Live-Cell-Bildgebung Automatisierte Zellzählung und Morphologiezusammenführung Messungen von Längen- / Flächen- / Fluoreszenz-Verteilungen- (Histogramme)
ChemoStar Touch ECL & FL Imager
INTAS
Spezifikationen:
6,0 MPixel CCD Kamera
UV + Vis Transmission
Verstärkte Chemilumineszenz (ECL)
Fluoreszenz-Detektion (LED Cube RED 609nm)
Weitere verfügbare ECL/FL Imager:
LAS 3000 (Fujifilm)
Image Quant LAS 4000 (GE Healthcare)
Ausgewählte Anwendungen:
Quantitative Auswertung von Western Blots (WB)
SDS-PAGE und Agarose Gel Dokumentation
Fluoreszenzdetektion von PAGE-Gelen
Quantitative Echtzeit-PCR
Applied Biosystems Quant Studio3
Thermo Scientific
Spezifikationen:
96 Wells (Reaktionsvolumen 10–100 μL)
Anregungs-/Detektionsbereich 450–600 nm/500–640 nm
Multiplexing von bis zu 4 Zielsequenzen
Drei unabhängige temperierte Zonen
Anwendungen:
Quantifikation von Gen-Expressionsniveaus (qPCR).
Indirekte Bestimmung der Proteinstabilität mittels Differential Scanning Fluorometry (DSF).
Weitere zugängliche Analytische Instrumente:
IncuCyte Zoom Live Cell Analyse System (Sartorius)
CytoFLEX Durchflusszytometer (Beckman Coulter)
Protein- und Probenvorbereitung
FPLC-Systeme
NGC Quest 10 Plus
BioRad
Spezifikationen:
Kolben-Gradientenpumpen (bis zu 252 bar; 25,2 MPa)
Flussrate regelbar: 0,001–10 ml/min
Einkanal-UV-Detektor (bei 280 nm)
Separate Probenpumpe
Fraktioniereinheit BioFrac
ÄKTA Start
Ge Healthcare
Spezifikationen:
Niederdruck Peristaltikpumpe
Einkanal-UV-Detektor (bei 280 nm)
Fraktioniereinheit Frac30
Zubehör: Elektrophorese-System MiniPrep Cell (BioRad)
Weitere verfügbare FPLC-Systeme: ÄKTA Prime plus (GE Healthcare)
Anwendungen:
Proteinreinigung mittels verschiedener Chromatographie-Strategien
- Affinität (IMAC, MBP-Tag, Strep-Tag, GST-Tag)
- Ionenaustausch (Anion, Kation)
- Größenausschlusschromatographie (SEC), Entsalzung
Pipettierroboter
epMotion 5075t
Eppendorf
Spezifikationen/Zubehör:
15 Tisch-Stellplätze
1- und 8-Kanal Pipettierwerkzeuge (1 µL-1000 µL)
Transfer-Greifer
Thermomixer-Einheit (bis zu 1400 U/min, 10-95°C)
2 temperierbare Stellplätze (2-100°C)
Magnet Separationsmodul (96well-Format)
Ausgewählte Anwendungen:
Halbautomatische DNA-Miniprep bis zu 96 Proben parallel
Automatisierte rekombinante Proteinreinigung im kleinen Maßstab
Automatisierte MALDI-Massenspektrometrie-Probenvorbereitung
Hochdurchsatz-Aliquotierung (bis zu 192 Reaktionsgefäße parallel)
Probenvorbereitung für die Massenspektrometrie
Kabinet für kontaminationsfreie Arbeiten
Eigenbau
Spezifikationen / Zubehör:
- Aspirator
- Zentrifuge Minispin (Eppendorf)
- Probenschleuse
- Magnetständer
Anwendungen:
Analytische Arbeitsabläufe für MS-Proben
Pulldown-Experimente mit magnetischen Beads oder Zentrifugation
Gefriertrocknung und Vakuumkonzentrierung
ALPHA 1-2 LD Gefriertrockner
Martin Christ
Spezifikationen:
Temperaturgrenze: -65°C
Vakuumgrenze <0.01 mbar (Pumpe RD-8; Vacuubrand)
Probenkapazität: 8 Vakuum-Adapter (für NS32/29 Rundkolben)
Vakuumverschlussglas 600 mL für div. Probengrößen (0,5 mL – 50 mL)
ALPHA RVC Rotations-Vakuumkonzentrator
Martin Christ
Spezifikationen:
Druckregelung 1000 – 1 mbar
Rotationsgeschwindigkeit: bis 1300 U/min
Temperaturregelung: 0 - 60°C
Zubehör: Alpha 1-2 Kältefalle + Vakuumpumpe (Martin Christ)
Anwendungen:
Lyophilisierung von Proteinen, Peptiden oder Chemikalien
Schnelle Vakuum-Konzentration von flüssigen Proben
Kultivierung und Prozessierung von Zellen
Zellkultur
Ausstattung / Spezifikationen:
Biologische Sicherheitswerkbänke (Klasse 2) in S2 Laboratoren (Herasafe, Thermo)
CO2-Inkubatoren (Heracell, Thermo)
Automatisierter Fluoreszenz-Zellzähler (Countess II FL, Thermo)
Anwendung:
Kultivierung verschiedener eukaryotischer Zelllinien und Primärzellen
Lentivirale Transfektion von verschiedenen eukaryotischen Zelllinien
Elektroporation
NEON Transfektionssystem
Invitrogen / Thermo Scientific
Spezifikationen:
Spezifische biologisch kompatible Pipettenspitzenkammer
Transfektionskapazität: 2 x 104 bis 6 x 106 Zellen pro Reaktion
Anwendungen:
Hocheffiziente Transfektion von extrem schwierigen Zellen wie Immun-, Primär- oder Stammzellen
Einbringung von DNA, RNA oder Proteinen in Zellen
Gene Pulser Xcell Elektroporationssystem
BioRad
Spezifikationen:
Küvetten-basiertes System:
Haupteinheit, CE-Modul, PC-Modul und Küvettenkammer
Regelbare Kapazität: 10–500 V, 25–3275 µF in 25 µF Inkrementen
Ausgangsspannung: 10–3000 V
Anwendungen:
Transformation elektro-kompetenter mikrobieller Zellen (Bakterien und Hefe) (PC-Modul)
Transfektion von eukaryotischen Zelllinien mit Nukleinsäuren durch Elektroporation (CE-Modul)
Schüttelinkubation
Multitron Standard / Innova 44
Infors HT / New Brunswick
Spezifikationen:
5 Schüttelinkubatoren
Flächenkapazität 6 x 5L Erlenmeyerkolben pro Inkubator
Temperaturregelung: 10-45°C
Schüttelgeschwindigkeit: 30-300 U/min
Zeitprogramme möglich
Anwendung:
Multi-Liter parallele Kultivierung von E. coli oder Hefe
für die rekombinante Proteinexpression
Fermenter
Fermenter – Parallel Bioreaktor System
DASGIP von Eppendorf
Komponenten / Spezifikationen:
BioBlock - 4x 2L Parallel-Batch-Reaktoren (Temp- und Rührsteuerung)
TC4 – Temperaturregelungsmodul
MP8 - 8-Kanal-Peristaltikpumpe (pH-Regulierung, AF, Feed)
PH4 - Sensormodul für pH- und DO-Sensorik
OD4 - Sensormodul für OD-Erfassung
MX4/4 - Gasmischmodul, ausgestattet mit Druckluft und O2
Ausgewählte Anwendungen:
Rekombinante Proteinexpression in Bakterien und Hefe mit hoher Zelldichte.
Expression von isotopenmarkierten Proteinen (z.B. 2H, 15N, 13C)
Ortsspezifischer Einbau von PTMs über unnatürlichen Aminosäuren (UAAs)
Zellaufschluss
CF1 Hochdruck-Zellaufschlusssystem
Constant Systems
Spezifikationen:
min. Probenvolumen: 10 mL
Druckgrenze: 2700 bar (40 KPSI) (frei wählbar)
Prozessivität: 100 mL/min
SFX250 Digitaler Ultraschalldesintegrator
Branson
Spezifikationen / Zubehör:
max. Leistungsaufnahme: 300 W (Amplitude 10-100%)
Probenvolumen: 0,5 mL – 500 mL
Ein-Spitzen und 24-Spitzen (Adapter für Hochdurchsatz) Ultraschallsonden
Anwendungen:
Zellaufschluss von Bakterien und Hefen
Entgasen von Pufferlösungen (nur über Ultraschall)
Superspeed und Ultrazentrifugation
Sorvall LYNX 6000 Superspeed Standzentrifuge
Thermo Scientific
Spezifikationen:
Max. Speed: 29.000 U/min
Max. relative Zentrifugalkraft: 100.605 x g
Max. Volumen: 6 x 1000 mL
Temperaturregelung: -20°C bis +40°C
Rotoens: Carbon Fibrelite
- F9-6x1000 LEX; F12-6x500 LEX; F20-12x50 LEX
Weitere verfügbare Zentrifugen:
- Sorvall RC 5Cplus; Sorvall RC6plus (Thermo Scientific)
- Rotoren: GSA; SS-34; SM-24
Anwendungen:
Zellernte aus bis zu 1 L-Kulturen
Klärung von Zelllysaten bis 500 mL
Optima L-60 Ultrazentrifuge
Beckman
Spezifikationen:
Max. Geschwindigkeit: 60.000 U/min
Max. relative Zentrifugalkraft: 485.000 x g
Rotoren:
- 70Ti; 50Ti; 55.2TI; SW 40TI; VTi50
Weitere UZ-Geräte:
- L7-80 Ultrazentrifuge (Beckman): Rotoren s.o.
- Tisch-Ultrazentrifuge OPTIMA-TL (Beckman)
Rotoren: TLA100; TLA100.2
Anwendungen:
Reinigung nativer Proteine
Isolierung von Zellkompartimenten
Dichte-Gradienten-Zentrifugation